La dermatite atopica è una malattia multifattoriale dovuta a una combinazione di fattori genetici e ambientali. I meccanismi fisiopatologici coinvolti nella DA sono molteplici: anomalie funzionali innate della barriera cutanea, in parte legate a mutazioni della filaggrina, una delle principali proteine strutturali della pelle; geni coinvolti nell'immunità innata e adattativa; infine, negli ultimi anni è stato chiarito il modello dell'ipotesi igienica: i fattori ambientali alterano la diversità del microbioma cutaneo e digestivo, e questa diversità sembra giocare un ruolo importante nello sviluppo dell'atopia.